Chuyện phim Spy x Family bắt đầu trong bối cảnh thời điểm mà tất cả các quốc gia trên thế giới đang tham gia vào một cuộc chiến tranh thông tin khốc liệt xảy ra sau những cánh cửa đóng kín, Westalis và Ostania đã ở trong tình trạng chiến tranh lạnh với nhau trong nhiều thập kỷ. Bộ phận Tập trung vào phía Đông của Dịch vụ Tình báo Westalis (WISE) cử điệp viên tài năng nhất của họ, “Twilight”, với nhiệm vụ tiếp cận một mục tiêu có ảnh hưởng hết sức nghiêm trọng đến nền hòa bình thế giới. Đó là gã Donovan Desmond, chủ tịch Đảng Thống nhất Quốc gia của Ostania, người đang đe dọa các nỗ lực hòa bình giữa hai quốc gia. Để làm được điều đó, nam chính Spy x Family phải xây dựng cho mình một vỏ bọc là một gia đình hạnh phúc và đứa con học trong ngôi trường danh giá. Bằng các biện pháp nghiệp vụ, anh lập tức hack ra được một bé gái đáng yêu và sau đó là một cô vợ xinh xắn hiền thục. Và từ đó một gia đình hạnh phúc kiểu mẫu được hình thành. Nhưng thực chất Twilight làm những điều đó đều phục vụ cho (Chiến dịch Strix) anh giả thân phận của bác sĩ tâm thần Loid Forger.